Date:
More to come in the Fall 2021.
Stay tuned...

Date:
June 22nd 2021 from 11am to 12pm
Language: English

Webinar:
Link to the conference room

Webinar slides in PDF:
GenAP Webinar

How can GenAP help you for data analysis and sharing
GenAP is a computing platform facilitating the work of researchers by offering tools such as Web applications leveraging Compute Canada resources.

You should attend our webinar if you ... :

• have data to share privately (on Canadian infrastructures) with internal or international collaborators;
• require public large data hosting (e.g. to visualize genomic datasets using the UCSC Genome Browser);
• are a life scientist that have large data to analyze but with limited command-line expertise;
• have single-cell data to analyze and dynamically annotate;
• are an instructor who wants to use Galaxy for teaching;
• are a software developer who wants to share his tool with a broad community of life scientists;
• work for a service facility and part of your end users need Compute Canada infrastructures.

We will cover all these use cases and others by explaining the main features of GenAP (genap.ca).

Date:
17 Juin 2021 de 11h à 12h
Langue de présentation: Français

Présentation en format PDF (en anglais):
Webinaire GenAP

Comment GenAP peut vous aider à analyser et partager vos données
GenAP est une plateforme informatique facilitant le travail des chercheurs en offrant des outils tels que des applications Web exploitant les ressources de Calcul Canada.

Vous devriez assister à notre webinaire si vous ... :

• avez des données à partager en privé (sur des infrastructures canadiennes) avec des collaborateurs internes ou internationaux;
• nécessitez un hébergement public de données volumineuses (par exemple pour visualiser des ensembles de données génomiques à l'aide du navigateur génomique de UCSC);
• êtes un chercheur des sciences de la vie et avez de grandes quantités de données à analyser sans sans toutefois posséder une grande expertise avec la ligne de commande;
• avez des données de cellules uniques à analyser et à annoter dynamiquement;
• êtes un instructeur qui souhaite utiliser Galaxy pour une formation;
• êtes un développeur de logiciels qui souhaite partager son outil avec une large communauté de scientifiques de la vie;
• travaillez pour une plateforme de services et une partie de vos utilisateurs finaux ont besoin des infrastructures de Calcul Canada.

Nous couvrirons tous ces cas d'utilisation et d'autres en expliquant les principales fonctionnalités de GenAP (genap.ca).

Date:
Oct. 15th, 2020
9:30am to 12pm

Workshop slides:
Introduction to GenAP
Galaxy introduction
Single-Cell tools in Galaxy
Single-Cell Analysis Portal

GenAP for Single-Cell researchers (Webinar)
This workshop is primarily targeted for health-science researchers specialized in Single-Cell analysis. In this webinar, we will go over the basics of how to get started with your working environment in GenAP (Genetics and Genomics Analysis Platform), followed by a demonstration on how to use Galaxy within GenAP. Finally, we will give a more detailed demonstration of how to take advantage of the single-cell tools implemented in GenAP, including Seurat, Scanpy for data-analysis, as well as UCSC Cell Browser and our in-house tool SCAP for annotation and visualization. To take advantage of GenAP services, please make sure that you have a working Compute Canada account available: CC account application